Частите, фрезовани с ЦПУ, могат да се произвеждат от различни материали в зависимост от изискванията на крайния продукт. В металния сектор сред най-често използваните материали са алуминий, стомана и неръждаема стомана. Алуминият често се избира заради малкото си тегло, добрата си обработваемост и устойчивост на корозия, докато стоманата е предпочитана заради своята твърдост и здравина. Неръждаемата стомана е особено подходяща за приложения, които изискват висока устойчивост на корозия, като например в медицинските технологии или в хранително-вкусовата промишленост.
В допълнение към металите, пластмасите, като POM (полиоксиметилен), ABS или PTFE (тефлон), също са много търсени. Те често се използват в приложения, при които се изисква лека конструкция, електрическа изолация или химическа устойчивост. Специални материали като инконел или титан, които могат да издържат както на високи температури, така и на екстремни механични натоварвания, се използват за особено взискателни приложения, например в космическата индустрия.