Ett brett spektrum av material kan bearbetas i CNC-bearbetning, inklusive metaller som aluminium, stål, rostfritt stål och koppar, men också plaster som POM eller PE. Varje material kräver speciella inställningar och verktyg för att uppnå bästa möjliga resultat. Bearbetning av rostfritt stål kräver t.ex. högre skärhastighet och speciella kylsmörjmedel, medan plast ofta bearbetas med lägre hastighet. Valet av rätt material beror på vilka krav som ställs på slutprodukten.